CpG甲基化特征预测早期肝癌的复发来自

JiliangQiu,BaogangPeng,YunqiangTang,YebenQian,PiGuo,MengfengLi,JunhangLuo,BinChen,HuiTang,CanliangLu,MuyanCai,ZunfuKe,WeiHe,YunZheng,DanXie,BinkuiLi,andYunfeiYuan

本刊负责人：李进；审校：肖慧娟；翻译：蒋梦捷

摘要

目的：越来越多的早期肝细胞癌（E-HCC）被确诊，但确诊的患者一半会复发。因此，当务之急是识别复发相关标志物。我们研究了CpG甲基化在预测早期肝癌患者复发中的有效性。

对象和方法：从四家独立中心纳入共例早期肝癌患者，分三个阶段进行研究。在探索阶段，应用Illumina甲基化KBeadChip芯片对66例肿瘤标本进行分析。运用最小化的绝对收缩和选择运算符（LeastAbsoluteShrinkageandSelectorOperation,LASSO）和支持向量机联合递归特征去除（SupportVectorMachine-RecursiveFeatureElimination,SVM-RFE）两种算法选择差异显著的CpG位点。在建模阶段，用Cox回归模型将CpG进一步缩少至个。在验证阶段，采用一个内部队列（n=）和两个外部队列（n=和n=）对候选CpG进行验证。

结果：在建模阶段，综合考虑了由LASSO和SVM-RFE法筛选出的46个CpG位点后，SCAN域蛋白3、Src同源结构域3-生长因子受体结合蛋白2样相互作用蛋白1及肽酶抑制剂3这3个CpG被作为候选预测因子。在此基础上，建立E-HCC甲基化特征（MSEH），将建模队列中的患者分为复发高风险组和低风险组（p0.）。MSEH的预测性能在一个内部队列（p0.）及两个外部队列（p0.,p=0.）中得到了验证。此外，在建模阶段生成了一个包含MSEH、肿瘤分化程度、肝硬化、乙肝病毒表面抗原和抗病毒治疗因素的列线图预测5年无复发生存率，在三个验证队列中运行良好（一致性指数分别为0.、0.和0.）。

结论:MSEH，基于3个CpG的特征，有助于预测早期肝癌患者的复发。

JClinOncol35:-.?byAmericanSocietyofClinicalOncology

赞赏

长按







































白癜风专科的医院
白癜风能不能彻底治好